Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slfn8B1ARD8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slfn8B1ARD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slfn8B1ARD8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slfn8B1ARD8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slfn8B1ARD8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slfn8B1ARD8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slfn8B1ARD8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slfn8B1ARD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slfn8B1ARD8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slfn8B1ARD8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slfn8B1ARD8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slfn8B1ARD8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slfn8B1ARD8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slfn8B1ARD8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slfn8B1ARD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slfn8B1ARD8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slfn8B1ARD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slfn8B1ARD8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slfn8B1ARD8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slfn8B1ARD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slfn8B1ARD8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slfn8B1ARD8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slfn8B1ARD8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slfn8B1ARD8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slfn8B1ARD8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slfn8B1ARD8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slfn8B1ARD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slfn8B1ARD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slfn8B1ARD8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slfn8B1ARD8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slfn8B1ARD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slfn8B1ARD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slfn8B1ARD8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slfn8B1ARD8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slfn8B1ARD8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slfn8B1ARD8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slfn8B1ARD8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slfn8B1ARD8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slfn8B1ARD8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slfn8B1ARD8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slfn8B1ARD8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slfn8B1ARD8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slfn8B1ARD8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slfn8B1ARD8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slfn8B1ARD8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn8B1ARD8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn8B1ARD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slfn8B1ARD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slfn8B1ARD8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slfn8B1ARD8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slfn8B1ARD8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slfn8B1ARD8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Slfn8B1ARD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slfn8B1ARD8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slfn8B1ARD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slfn8B1ARD8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slfn8B1ARD8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slfn8B1ARD8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slfn8B1ARD8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slfn8B1ARD8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Slfn8B1ARD8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slfn8B1ARD8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slfn8B1ARD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slfn8B1ARD8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slfn8B1ARD8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slfn8B1ARD8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slfn8B1ARD8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slfn8B1ARD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slfn8B1ARD8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slfn8B1ARD8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slfn8B1ARD8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Slfn8B1ARD8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slfn8B1ARD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slfn8B1ARD8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slfn8B1ARD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slfn8B1ARD8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slfn8B1ARD8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn8B1ARD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slfn8B1ARD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slfn8B1ARD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slfn8B1ARD8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slfn8B1ARD8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slfn8B1ARD8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slfn8B1ARD8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms