Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Plcb2A3KGF7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Plcb2A3KGF7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Plcb2A3KGF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Plcb2A3KGF7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Plcb2A3KGF7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Plcb2A3KGF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Plcb2A3KGF7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Plcb2A3KGF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Plcb2A3KGF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Plcb2A3KGF7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Plcb2A3KGF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Plcb2A3KGF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Plcb2A3KGF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Plcb2A3KGF7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Plcb2A3KGF7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Plcb2A3KGF7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Plcb2A3KGF7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Plcb2A3KGF7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Plcb2A3KGF7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Plcb2A3KGF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Plcb2A3KGF7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Plcb2A3KGF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Plcb2A3KGF7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Plcb2A3KGF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Plcb2A3KGF7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Plcb2A3KGF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Plcb2A3KGF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Plcb2A3KGF7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Plcb2A3KGF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Plcb2A3KGF7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Plcb2A3KGF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Plcb2A3KGF7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Plcb2A3KGF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Plcb2A3KGF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Plcb2A3KGF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Plcb2A3KGF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Plcb2A3KGF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Plcb2A3KGF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Plcb2A3KGF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Plcb2A3KGF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Plcb2A3KGF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Plcb2A3KGF7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Plcb2A3KGF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Plcb2A3KGF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Plcb2A3KGF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Plcb2A3KGF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Plcb2A3KGF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Plcb2A3KGF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Plcb2A3KGF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Plcb2A3KGF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Plcb2A3KGF7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Plcb2A3KGF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Plcb2A3KGF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Plcb2A3KGF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Plcb2A3KGF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Plcb2A3KGF7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Plcb2A3KGF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Plcb2A3KGF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Plcb2A3KGF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Plcb2A3KGF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Plcb2A3KGF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plcb2A3KGF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Plcb2A3KGF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Plcb2A3KGF7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Plcb2A3KGF7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Plcb2A3KGF7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Plcb2A3KGF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Plcb2A3KGF7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Plcb2A3KGF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Plcb2A3KGF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Plcb2A3KGF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Plcb2A3KGF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Plcb2A3KGF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Plcb2A3KGF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Plcb2A3KGF7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Plcb2A3KGF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Plcb2A3KGF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Plcb2A3KGF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Plcb2A3KGF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Plcb2A3KGF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Plcb2A3KGF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Plcb2A3KGF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Plcb2A3KGF7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Plcb2A3KGF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms