Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Plcb2A3KGF7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Plcb2A3KGF7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Plcb2A3KGF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Plcb2A3KGF7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Plcb2A3KGF7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Plcb2A3KGF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Plcb2A3KGF7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Plcb2A3KGF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Plcb2A3KGF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Plcb2A3KGF7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Plcb2A3KGF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32,27■■■□□ 2,76
Plcb2A3KGF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Plcb2A3KGF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Plcb2A3KGF7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Plcb2A3KGF7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Plcb2A3KGF7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Plcb2A3KGF7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Plcb2A3KGF7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Plcb2A3KGF7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Plcb2A3KGF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Plcb2A3KGF7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Plcb2A3KGF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Plcb2A3KGF7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Plcb2A3KGF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31,76■■■□□ 2,67
Plcb2A3KGF7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Plcb2A3KGF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Plcb2A3KGF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Plcb2A3KGF7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Plcb2A3KGF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Plcb2A3KGF7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Plcb2A3KGF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
Plcb2A3KGF7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
Plcb2A3KGF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Plcb2A3KGF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Plcb2A3KGF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Plcb2A3KGF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Plcb2A3KGF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Plcb2A3KGF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Plcb2A3KGF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Plcb2A3KGF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Plcb2A3KGF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Plcb2A3KGF7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Plcb2A3KGF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Plcb2A3KGF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Plcb2A3KGF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Plcb2A3KGF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Plcb2A3KGF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Plcb2A3KGF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Plcb2A3KGF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,31■■■□□ 2,6
Plcb2A3KGF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Plcb2A3KGF7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Plcb2A3KGF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Plcb2A3KGF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Plcb2A3KGF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Plcb2A3KGF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Plcb2A3KGF7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Plcb2A3KGF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Plcb2A3KGF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Plcb2A3KGF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Plcb2A3KGF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Plcb2A3KGF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Plcb2A3KGF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Plcb2A3KGF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Plcb2A3KGF7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Plcb2A3KGF7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Plcb2A3KGF7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Plcb2A3KGF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Plcb2A3KGF7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Plcb2A3KGF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,98■■■□□ 2,55
Plcb2A3KGF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Plcb2A3KGF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Plcb2A3KGF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Plcb2A3KGF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Plcb2A3KGF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Plcb2A3KGF7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Plcb2A3KGF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Plcb2A3KGF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Plcb2A3KGF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Plcb2A3KGF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Plcb2A3KGF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Plcb2A3KGF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Plcb2A3KGF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Plcb2A3KGF7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Plcb2A3KGF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms