Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d2A3KG59 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d2A3KG59 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d2A3KG59 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pm20d2A3KG59 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d2A3KG59 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d2A3KG59 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pm20d2A3KG59 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pm20d2A3KG59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pm20d2A3KG59 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pm20d2A3KG59 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pm20d2A3KG59 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pm20d2A3KG59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms