Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r232A2RTT5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r232A2RTT5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r232A2RTT5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r232A2RTT5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r232A2RTT5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r232A2RTT5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r232A2RTT5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r232A2RTT5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r232A2RTT5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r232A2RTT5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r232A2RTT5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r232A2RTT5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r232A2RTT5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r232A2RTT5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r232A2RTT5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r232A2RTT5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r232A2RTT5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r232A2RTT5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r232A2RTT5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r232A2RTT5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r232A2RTT5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r232A2RTT5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r232A2RTT5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r232A2RTT5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r232A2RTT5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r232A2RTT5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r232A2RTT5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r232A2RTT5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r232A2RTT5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r232A2RTT5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r232A2RTT5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r232A2RTT5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r232A2RTT5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r232A2RTT5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r232A2RTT5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r232A2RTT5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r232A2RTT5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r232A2RTT5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r232A2RTT5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r232A2RTT5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r232A2RTT5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r232A2RTT5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r232A2RTT5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r232A2RTT5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r232A2RTT5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r232A2RTT5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r232A2RTT5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r232A2RTT5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r232A2RTT5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r232A2RTT5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r232A2RTT5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r232A2RTT5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r232A2RTT5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r232A2RTT5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r232A2RTT5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r232A2RTT5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r232A2RTT5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r232A2RTT5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r232A2RTT5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r232A2RTT5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r232A2RTT5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r232A2RTT5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r232A2RTT5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r232A2RTT5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r232A2RTT5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms