Protein–RNA interactions for Protein: A2AP83

Fnd3c2, Fibronectin type III domain-containing 3C2, mousemouse

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnd3c2A2AP83 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fnd3c2A2AP83 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fnd3c2A2AP83 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fnd3c2A2AP83 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fnd3c2A2AP83 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fnd3c2A2AP83 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fnd3c2A2AP83 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fnd3c2A2AP83 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fnd3c2A2AP83 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fnd3c2A2AP83 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fnd3c2A2AP83 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fnd3c2A2AP83 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fnd3c2A2AP83 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fnd3c2A2AP83 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fnd3c2A2AP83 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fnd3c2A2AP83 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fnd3c2A2AP83 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fnd3c2A2AP83 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fnd3c2A2AP83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fnd3c2A2AP83 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fnd3c2A2AP83 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fnd3c2A2AP83 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fnd3c2A2AP83 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fnd3c2A2AP83 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fnd3c2A2AP83 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fnd3c2A2AP83 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fnd3c2A2AP83 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fnd3c2A2AP83 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fnd3c2A2AP83 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fnd3c2A2AP83 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fnd3c2A2AP83 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fnd3c2A2AP83 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fnd3c2A2AP83 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fnd3c2A2AP83 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fnd3c2A2AP83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fnd3c2A2AP83 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fnd3c2A2AP83 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fnd3c2A2AP83 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fnd3c2A2AP83 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fnd3c2A2AP83 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fnd3c2A2AP83 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fnd3c2A2AP83 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fnd3c2A2AP83 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fnd3c2A2AP83 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fnd3c2A2AP83 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fnd3c2A2AP83 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fnd3c2A2AP83 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fnd3c2A2AP83 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fnd3c2A2AP83 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fnd3c2A2AP83 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fnd3c2A2AP83 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fnd3c2A2AP83 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fnd3c2A2AP83 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fnd3c2A2AP83 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fnd3c2A2AP83 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fnd3c2A2AP83 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fnd3c2A2AP83 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fnd3c2A2AP83 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fnd3c2A2AP83 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fnd3c2A2AP83 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fnd3c2A2AP83 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fnd3c2A2AP83 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fnd3c2A2AP83 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fnd3c2A2AP83 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fnd3c2A2AP83 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fnd3c2A2AP83 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fnd3c2A2AP83 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fnd3c2A2AP83 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fnd3c2A2AP83 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fnd3c2A2AP83 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fnd3c2A2AP83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fnd3c2A2AP83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fnd3c2A2AP83 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fnd3c2A2AP83 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fnd3c2A2AP83 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fnd3c2A2AP83 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fnd3c2A2AP83 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fnd3c2A2AP83 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fnd3c2A2AP83 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fnd3c2A2AP83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fnd3c2A2AP83 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnd3c2A2AP83 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fnd3c2A2AP83 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fnd3c2A2AP83 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms