Protein–RNA interactions for Protein: A2AIL4

Ndufaf6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf6A2AIL4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufaf6A2AIL4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufaf6A2AIL4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufaf6A2AIL4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufaf6A2AIL4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufaf6A2AIL4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufaf6A2AIL4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufaf6A2AIL4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufaf6A2AIL4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufaf6A2AIL4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf6A2AIL4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufaf6A2AIL4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufaf6A2AIL4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufaf6A2AIL4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufaf6A2AIL4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufaf6A2AIL4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf6A2AIL4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufaf6A2AIL4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufaf6A2AIL4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf6A2AIL4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufaf6A2AIL4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufaf6A2AIL4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufaf6A2AIL4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufaf6A2AIL4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufaf6A2AIL4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufaf6A2AIL4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufaf6A2AIL4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf6A2AIL4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufaf6A2AIL4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufaf6A2AIL4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufaf6A2AIL4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf6A2AIL4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf6A2AIL4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf6A2AIL4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf6A2AIL4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf6A2AIL4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufaf6A2AIL4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf6A2AIL4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufaf6A2AIL4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufaf6A2AIL4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf6A2AIL4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufaf6A2AIL4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf6A2AIL4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf6A2AIL4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf6A2AIL4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufaf6A2AIL4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufaf6A2AIL4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufaf6A2AIL4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufaf6A2AIL4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufaf6A2AIL4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufaf6A2AIL4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufaf6A2AIL4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufaf6A2AIL4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufaf6A2AIL4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufaf6A2AIL4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufaf6A2AIL4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufaf6A2AIL4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufaf6A2AIL4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufaf6A2AIL4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufaf6A2AIL4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf6A2AIL4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf6A2AIL4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf6A2AIL4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf6A2AIL4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf6A2AIL4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf6A2AIL4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf6A2AIL4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf6A2AIL4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf6A2AIL4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf6A2AIL4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf6A2AIL4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf6A2AIL4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms