Protein–RNA interactions for Protein: A2A9Q0

Fndc10, Fibronectin type III domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc10A2A9Q0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fndc10A2A9Q0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fndc10A2A9Q0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc10A2A9Q0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc10A2A9Q0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc10A2A9Q0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc10A2A9Q0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc10A2A9Q0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc10A2A9Q0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc10A2A9Q0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fndc10A2A9Q0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fndc10A2A9Q0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc10A2A9Q0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc10A2A9Q0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc10A2A9Q0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc10A2A9Q0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc10A2A9Q0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc10A2A9Q0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc10A2A9Q0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc10A2A9Q0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fndc10A2A9Q0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc10A2A9Q0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc10A2A9Q0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc10A2A9Q0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc10A2A9Q0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc10A2A9Q0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc10A2A9Q0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc10A2A9Q0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc10A2A9Q0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc10A2A9Q0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc10A2A9Q0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc10A2A9Q0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc10A2A9Q0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc10A2A9Q0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc10A2A9Q0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc10A2A9Q0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc10A2A9Q0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc10A2A9Q0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc10A2A9Q0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc10A2A9Q0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc10A2A9Q0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc10A2A9Q0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fndc10A2A9Q0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fndc10A2A9Q0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc10A2A9Q0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc10A2A9Q0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc10A2A9Q0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fndc10A2A9Q0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc10A2A9Q0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms