Protein–RNA interactions for Protein: A2A447

Rhox2b, Reproductive homeobox 2B, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2bA2A447 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rhox2bA2A447 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhox2bA2A447 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhox2bA2A447 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhox2bA2A447 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhox2bA2A447 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhox2bA2A447 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox2bA2A447 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhox2bA2A447 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhox2bA2A447 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhox2bA2A447 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rhox2bA2A447 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rhox2bA2A447 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox2bA2A447 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox2bA2A447 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox2bA2A447 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox2bA2A447 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhox2bA2A447 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhox2bA2A447 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhox2bA2A447 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhox2bA2A447 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhox2bA2A447 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhox2bA2A447 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhox2bA2A447 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhox2bA2A447 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhox2bA2A447 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox2bA2A447 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhox2bA2A447 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhox2bA2A447 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox2bA2A447 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhox2bA2A447 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rhox2bA2A447 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox2bA2A447 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhox2bA2A447 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhox2bA2A447 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox2bA2A447 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox2bA2A447 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhox2bA2A447 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhox2bA2A447 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox2bA2A447 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox2bA2A447 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox2bA2A447 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox2bA2A447 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox2bA2A447 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rhox2bA2A447 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox2bA2A447 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhox2bA2A447 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox2bA2A447 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhox2bA2A447 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhox2bA2A447 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox2bA2A447 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox2bA2A447 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhox2bA2A447 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhox2bA2A447 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox2bA2A447 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhox2bA2A447 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox2bA2A447 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox2bA2A447 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox2bA2A447 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox2bA2A447 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox2bA2A447 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox2bA2A447 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox2bA2A447 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhox2bA2A447 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox2bA2A447 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox2bA2A447 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox2bA2A447 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox2bA2A447 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox2bA2A447 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox2bA2A447 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhox2bA2A447 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms