Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cul4bA2A432 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cul4bA2A432 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cul4bA2A432 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cul4bA2A432 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cul4bA2A432 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cul4bA2A432 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cul4bA2A432 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cul4bA2A432 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cul4bA2A432 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cul4bA2A432 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cul4bA2A432 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cul4bA2A432 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cul4bA2A432 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cul4bA2A432 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cul4bA2A432 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cul4bA2A432 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cul4bA2A432 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cul4bA2A432 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cul4bA2A432 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cul4bA2A432 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cul4bA2A432 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cul4bA2A432 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cul4bA2A432 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cul4bA2A432 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cul4bA2A432 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cul4bA2A432 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cul4bA2A432 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cul4bA2A432 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cul4bA2A432 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cul4bA2A432 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cul4bA2A432 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cul4bA2A432 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cul4bA2A432 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cul4bA2A432 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cul4bA2A432 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Cul4bA2A432 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cul4bA2A432 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cul4bA2A432 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul4bA2A432 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul4bA2A432 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul4bA2A432 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cul4bA2A432 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul4bA2A432 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul4bA2A432 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul4bA2A432 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul4bA2A432 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cul4bA2A432 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Cul4bA2A432 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cul4bA2A432 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cul4bA2A432 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cul4bA2A432 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cul4bA2A432 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Cul4bA2A432 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cul4bA2A432 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cul4bA2A432 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cul4bA2A432 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cul4bA2A432 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cul4bA2A432 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cul4bA2A432 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cul4bA2A432 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cul4bA2A432 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cul4bA2A432 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cul4bA2A432 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cul4bA2A432 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cul4bA2A432 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cul4bA2A432 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cul4bA2A432 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cul4bA2A432 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cul4bA2A432 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cul4bA2A432 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cul4bA2A432 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cul4bA2A432 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cul4bA2A432 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cul4bA2A432 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cul4bA2A432 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cul4bA2A432 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Cul4bA2A432 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cul4bA2A432 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cul4bA2A432 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cul4bA2A432 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cul4bA2A432 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cul4bA2A432 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul4bA2A432 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul4bA2A432 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cul4bA2A432 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul4bA2A432 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul4bA2A432 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul4bA2A432 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul4bA2A432 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul4bA2A432 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul4bA2A432 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cul4bA2A432 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms