Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2l1A2A259 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2l1A2A259 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2l1A2A259 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pkd2l1A2A259 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pkd2l1A2A259 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkd2l1A2A259 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2l1A2A259 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkd2l1A2A259 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkd2l1A2A259 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2l1A2A259 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2l1A2A259 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2l1A2A259 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2l1A2A259 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2l1A2A259 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2l1A2A259 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2l1A2A259 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2l1A2A259 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2l1A2A259 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2l1A2A259 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2l1A2A259 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2l1A2A259 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2l1A2A259 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2l1A2A259 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2l1A2A259 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2l1A2A259 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pkd2l1A2A259 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2l1A2A259 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2l1A2A259 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2l1A2A259 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2l1A2A259 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2l1A2A259 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2l1A2A259 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2l1A2A259 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2l1A2A259 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2l1A2A259 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2l1A2A259 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2l1A2A259 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2l1A2A259 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2l1A2A259 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2l1A2A259 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2l1A2A259 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2l1A2A259 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2l1A2A259 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pkd2l1A2A259 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2l1A2A259 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2l1A2A259 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2l1A2A259 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2l1A2A259 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2l1A2A259 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2l1A2A259 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2l1A2A259 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2l1A2A259 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2l1A2A259 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pkd2l1A2A259 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2l1A2A259 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2l1A2A259 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2l1A2A259 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2l1A2A259 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2l1A2A259 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2l1A2A259 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2l1A2A259 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2l1A2A259 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2l1A2A259 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2l1A2A259 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2l1A2A259 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2l1A2A259 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2l1A2A259 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkd2l1A2A259 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2l1A2A259 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2l1A2A259 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2l1A2A259 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkd2l1A2A259 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkd2l1A2A259 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkd2l1A2A259 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkd2l1A2A259 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkd2l1A2A259 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2l1A2A259 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l1A2A259 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l1A2A259 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l1A2A259 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l1A2A259 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2l1A2A259 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2l1A2A259 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2l1A2A259 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2l1A2A259 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms