Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Trbv12-1A0A0B4J1H0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,39■■□□□ 1,5
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Trbv12-1A0A0B4J1H0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Trbv12-1A0A0B4J1H0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
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