Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B619

Trav14d-3-dv8, MCG142750 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,43
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Trav14d-3-dv8A0A075B619 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17,72■□□□□ 0,43
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,63■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17,6■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,41
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,56■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Trav14d-3-dv8A0A075B619 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,49■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17,45■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,43■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Trav14d-3-dv8A0A075B619 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17,39■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Trav14d-3-dv8A0A075B619 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17,3■□□□□ 0,36
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,22■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,18■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17,18■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17,15■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,15■□□□□ 0,34
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Trav14d-3-dv8A0A075B619 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms