Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DysfQ9ESD7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms