Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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