Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox2aQ9D4Y3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox2aQ9D4Y3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms