Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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