Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms