Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx18Q8VDS8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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