Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms