Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms