Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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