Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim27Q62158 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim27Q62158 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim27Q62158 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim27Q62158 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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