Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Nfe2l1Q61985 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nfe2l1Q61985 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nfe2l1Q61985 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nfe2l1Q61985 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nfe2l1Q61985 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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