Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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