Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms