Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ssbp4Q3U4B1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ssbp4Q3U4B1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ssbp4Q3U4B1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ssbp4Q3U4B1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ssbp4Q3U4B1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ssbp4Q3U4B1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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