Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd11Q1RNF8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms