Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms