Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NrepQ07475 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NrepQ07475 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms