Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms