Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms