Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms