Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms