Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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