Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5bP21271 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms