Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms