Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06323 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06323 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06323 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms