Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms