Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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