Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms