Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tlr5Q9JLF7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tlr5Q9JLF7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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