Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms