Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jam3Q9D8B7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms