Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms