Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms