Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms