Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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