Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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