Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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