Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r1bQ60829 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r1bQ60829 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms